Η Άνδρος είναι ένα νησί με μεγάλη ποικιλία ενδιαιτημάτων, πλούσια βλάστηση και πολλά νερά, στοιχεία που της δίνουν ξεχωριστό χαρακτήρα από τα υπόλοιπα νησιά των Κυκλάδων. Είναι το Κυκλαδονήσι με την πλουσιότερη χλωρίδα.

Το φυσικό περιβάλλον είναι ιδιαίτερα αξιόλογο, χαρακτηρίζεται από βλάστηση με ποιότητα και πυκνότητα, σπάνια στο Αιγαίο, και εμπλουτίζεται από ανθρώπινες κατασκευές σε απόλυτη αρμονία μ' αυτό.

Σημαντικά οικοσυστήματα της Άνδρου
Ιδιαίτερο ενδιαφέρον παρουσιάζουν τα οικοσυστήματα των παρακάτω περιοχών :
1. Κοιλάδα Μενήτων - Υψηλού - Χώρας
2. Κοιλάδα Αποικιών - Στενιών
3. Κοιλάδα Μεσαριάς - Λιβαδιών - Χώρας
4. Κοιλάδα Βουνίου - Συνετίου
5. Κοιλάδα Βουρκωτής
6. Κοιλάδα Κατακοίλου - Ατενίων
7. Κοιλάδα Άρνης - Βάρης
8. Κοιλάδα Αμόλοχου - Βαριδίου - Ζόρκου.

Άφθονη είναι η θαμνώδης βλάστηση (σχίνοι, κουμαριές, μυρτιές, σπάρτα, δάφνες, ροδοδάφνες κ.α.). Επίσης συναντώνται σε αρκετά μέρη του νησιού Κυκλάδων συστάδες από κυπαρίσσια, πλατάνια, ιτιές, λεύκες, αμυγδαλιές, μυρτιές, ελιές, καλαμιές, συκιές κ.α.,

Η Άνδρος κατά τη διάρκεια της άνοιξης γεμίζει από αγριολούλουδα, όπως ανεμώνες, παπαρούνες, ορχιδέες.

Στην Άνδρο απαντούν αρκετά ελληνικά ενδημικά, αλλά και σπάνια -απειλούμενα και προστατευόμενα (με βάση την Ελληνική και Διεθνή Νομοθεσία ) είδη χλωρίδα. Η γεωγραφική θέση της περιοχής, η γεωλογική και η παλαιογεωγραφία της, συνετέλεσαν στην απομόνωση ορισμένων ειδών και στην δημιουργία νέων ειδών.

Η ορνιθοπανίδα στην Άνδρο είναι ιδιαίτερα σημαντική καθόσον αποτελεί σημείο από το οποίο διέρχονται τα πουλιά κατά τη διάρκεια της μετανάστευσής τους από την Αφρική στην Ευρώπη και αντίθετα. Έχουν παρατηρηθεί πολλά είδη πτηνών την Άνοιξη και το Φθινόπωρο, ιδίως στους υγροτόπους που υπάρχουν στο νησί οι οποίοι αποτελούν σημαντικό σταθμό ξεκούρασης για τα μεταναστευτικά πουλιά.